慈雲寺（じうんじ）は、各地にある仏教寺院。
日本
- 慈雲寺 (茨城県大子町)
- 慈雲寺 (日光市) - 栃木県日光市にある天台宗の寺院
- 慈雲寺 (佐野市) - 栃木県佐野市にある曹洞宗の寺院
- 慈雲寺 (船橋市) - 千葉県船橋市にある曹洞宗の寺院
- 慈雲寺 (横浜市) - 神奈川県横浜市にある日蓮宗の寺院
- 慈雲寺 (金沢市) - 石川県金沢市にある法華宗真門流の寺院、慈雲寺冨田家石廟群は金沢市指定文化財
- 慈雲寺 (甲州市) - 山梨県甲州市にある臨済宗妙心寺派の寺院
- 慈雲寺 (長野県下諏訪町) - 長野県諏訪郡下諏訪町にある臨済宗妙心寺派の寺院、日根野高吉の墓がある
- 慈雲寺 (高山市) - 岐阜県高山市にある臨済宗妙心寺派の寺院
- 慈雲寺 (名古屋市) - 愛知県名古屋市にある西山浄土宗の寺院
- 慈雲寺 (新城市) - 愛知県新城市にある曹洞宗の寺院
- 慈雲寺 (豊橋市) - 愛知県豊橋市にある臨済宗妙心寺派の寺院
- 慈雲寺 (知多市) - 愛知県知多市にある臨済宗妙心寺派の寺院、一色範光の墓がある
- 慈雲寺 (愛知県大治町) - 愛知県海部郡大治町にある臨済宗妙心寺派の寺院
- 慈雲寺 (熊野市) - 三重県熊野市にある曹洞宗の寺院
- 慈雲寺 (京都市) - 京都府京都市にある日蓮宗の寺院
台湾
- 慈雲寺 (嘉義県) - 台湾の嘉義県阿里山にある寺院
中国
- 慈雲寺 (重慶市) - 中国の重慶市にある寺院
関連項目
- 慈雲院 - 曖昧さ回避
